ありがとうございます！
アニメーションを指定して、ランダムに呼び出したいSEをリスト化するのは、まさにこのようなイメージです！
あとは、変えたい箇所のSEのみを変更出来れば…なのですが…（この部分がやはり重要でして…）
例えば、下記のような設定内容の場合…
SEとフラッシュのタイミング
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No. SE
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#001 SE・A（仮）＊固定で良い
#006 SE・B（仮）※いくつかの候補からランダムに置き換えたい※1
#010 SE・C（仮）※いくつかの候補からランダムに置き換えたい※2 ※1と2は呼び出したいSEリストが異なるイメージ
#016 SE・D（仮）＊固定で良い
…といったものを思い描いていました。
ランダム化したいフレームNo.は、アニメごとに異なりますので、例えば#006固定…というわけではありません。
■別案について
あらかじめ変えたい箇所のSEを変えた同じアニメーションを、例えば3つ用意しておいて、
スキル（仮にA）を使用した時に、この３つの中からどれか一つのアニメが再生される…でも
同じ表現になるので、こちらの方法でも構いません。
何だか、凄く無理を書いているような気がしてきてしまいました…申し訳ありませんｍ（＿＿；）ｍ